Ultima Genomics, Inc. heeft een brede samenwerking met NVIDIA onthuld die gebruik maakt van AI-versnelde analyses in meerdere stadia van het DNA-sequencing- en analyseproces. De samenwerking omvat het gebruik van NVIDIA GPU's voor deep learning in fotometrie en base calling, en zal binnenkort ook de versnelling van variant calling omvatten. De afgelopen vijf jaar heeft Ultima Genomics een fundamenteel nieuwe sequencing-architectuur ontwikkeld die ontworpen is om verder te schalen dan conventionele benaderingen, met inbegrip van volledig andere flow cell engineering, sequencing-chemie, en machine learning.

Ultima zit momenteel in een early access programma voor de UG 100™, zijn eerste high-throughput next-generation sequencing instrument dat gebruik maakt van deze nieuwe technologie, die klanten in staat stelt sequencinggegevens van hoge kwaliteit te genereren tegen een kostprijs van $1/Gb. Genomics Meets AI: Het Ultima-instrument maakt gebruik van NVIDIA A30 GPU's met het NVIDIA Clara [2] AI-rekenplatform om zeer nauwkeurige en versnelde primaire en secundaire analyses te bieden voor klanten die genomische analyses op schaal willen uitvoeren. Ultima heeft afzonderlijk partnerschappen aangekondigd om Ultima-specifieke germline variant calling pipelines te ontwikkelen voor Google's DeepVariant.

Deze aangepaste modellen kunnen worden uitgevoerd binnen NVIDIA Clara Parabricks, dat deze en andere toepassingen voor secundaire analyse versnelt. NVIDIA Clara Parabricks computational pipelines maken gebruik van NVIDIA's CUDA, HPC, AI en data analytics stacks om GPU-versnelde bibliotheken, pipelines, en referentietoepassingsworkflows te leveren voor primaire, secundaire en tertiaire analyse. Off-the-shelf oplossingen zijn gekoppeld aan een toolkit ter ondersteuning van de ontwikkeling van nieuwe toepassingen om tegemoet te komen aan de snel evoluerende behoeften van high-throughput genomische laboratoria.