De wetgeving, die eenzijdig delen zou vervangen van de post-Brexit deal die in 2020 door Groot-Brittannië en de EU is overeengekomen, moet terug naar het lagerhuis van het parlement voor een zogenaamde tweede lezing.
Minister van Buitenlandse Zaken Liz Truss zei dat de prioriteit van Londen lag bij de bescherming van een vredesakkoord uit 1998, waarvan Ierland, de Verenigde Staten en andere landen hebben gezegd dat het door de vervanging van delen van het Noord-Ierse Protocol in gevaar zou kunnen worden gebracht.
"Deze wetgeving zal de problemen oplossen die het Protocol heeft veroorzaakt, en ervoor zorgen dat goederen vrij kunnen circuleren binnen het Verenigd Koninkrijk, terwijl een harde grens wordt vermeden en de interne markt van de EU wordt gevrijwaard," zei Truss in een verklaring op zondag.
"Een oplossing via onderhandelingen heeft onze voorkeur en blijft onze voorkeur genieten, maar de EU blijft zich verzetten tegen een wijziging van het Protocol zelf - ook al veroorzaakt het overduidelijk ernstige problemen in Noord-Ierland - wat betekent dat wij verplicht zijn te handelen."
Groot-Brittannië is van plan sommige controles op goederen die vanuit de rest van het Verenigd Koninkrijk naar Noord-Ierland worden vervoerd, stop te zetten en het betwist de rol van het Hof van de EU.
De ambassadeur van de EU in Groot-Brittannië zei zondag dat de plannen van Groot-Brittannië onwettig en onrealistisch waren.
"Het is een verdrag dat wij hebben ondertekend, geratificeerd en dat in dit land zelfs door algemene verkiezingen is gegaan," zei Joao Vale de Almeida tegen Sky News.
De Europese Commissie heeft een rechtszaak tegen Groot-Brittannië aangespannen, wat mogelijk tot een handelsoorlog kan leiden.
EU-functionarissen zeggen dat Johnson probeert steun te herwinnen bij de wetgevers in zijn Conservatieve Partij, nadat hij eerder deze maand een vertrouwensstemming nipt gewonnen had.
