De aanvallers bonden dorpelingen vast en doodden hen met machetes en andere wapens terwijl anderen vluchtten, zei een leider van de burgermaatschappij, Maurice Mabele Musaidi, die het dodental aanvankelijk op 19 schatte.
Sommigen zijn mogelijk verdronken toen ze probeerden de Lamia rivier over te steken naar Oeganda, voegde hij eraan toe, en hij merkte op dat er nog veel mensen vermist worden.
Een plaatselijke functionaris zei later op maandag dat het dodental was gestegen tot minstens 33, waaronder een legerkapitein. Twee van hen waren kinderen die verdronken toen ze Oeganda probeerden te bereiken.
Drieëntwintig slachtoffers werden in het dorp begraven, terwijl zes mensen gegijzeld werden om geplunderde goederen te helpen dragen en vervolgens geëxecuteerd werden, voegde hij eraan toe.
Een humanitaire hulpverlener bevestigde dat zijn team 23 lichamen had helpen begraven. Hij zei dat het lichaam van de legerkapitein naar een andere locatie was gebracht.
Een woordvoerder van het Congolese leger zei dat de aanval in het Beni-gebied Watalinga chiefdom werd uitgevoerd door de Allied Democratic Forces (ADF), een gewapende groepering in Oost-Congo die trouw heeft gezworen aan Islamitische Staat.
De ADF ontstond in Oeganda voordat ze in de jaren 90 de grens over trok en wordt verantwoordelijk gehouden voor duizenden moorden in de afgelopen tien jaar.
Het leger van Congo zei dat het die nacht minstens zes van de militanten had gedood, zonder in detail te treden over de operatie.
De laatst gemelde moord vond plaats terwijl Congo zich opmaakt voor de algemene verkiezingen op 20 december, waarvoor de campagne volgende week begint.
De kiescommissie zei maandag dat de stemming door zou gaan ondanks de bezorgdheid over de veiligheid.
