NanoString Technologies, Inc. kondigde een update aan van de technologische roadmap voor de CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) die zal worden gepresenteerd op de 2023 Advances in Genome Biology and Technology General Meeting in Hollywood, FL. CosMx SMI is een single-cell imaging platform dat momenteel high plex imaging mogelijk maakt van meer dan 1.000 RNA en meer dan 60 proteïne analyten binnen morfologisch intacte hele weefseldoorsneden. Tijdens de Gold Sponsor workshop is het bedrijf van plan zijn innovatie roadmap te onthullen om 6.000-plex RNA en 120-plex proteïne analyten te kunnen leveren.

Hierdoor zullen onderzoekers gen- en eiwitexpressie kunnen visualiseren en kwantificeren bij enkelvoudige cel- en subcellulaire resoluties op ongekende plex-niveaus, inclusief RNA-plex dat meer dan 12 keer hoger is dan elk ander commercieel beschikbaar systeem. NanoString's ruimtelijke oplossingen zullen vertegenwoordigd zijn in 13 geaccepteerde abstracts, waaronder zes presentaties van klanten. De AtoMx SIP is een flexibel cloud-gebaseerd informatica platform dat de veilige, schaalbare opslag en analyse biedt die ruimtelijke biologie onderzoekers nodig hebben om hun workflow van studieontwerp tot peer-reviewed publicatie aan te sturen.

AtoMx SIP is compatibel met zowel het CosMx SMI-platform als de GeoMx Digital Spatial Profiler. Een cloud-based platform maakt het voor laboratoria overbodig om te investeren in hun eigen kostbare informatica-infrastructuur en verkort de rekentijd voor ruimtelijke biologie-analyses van dagen tot uren. Gebruikers hebben de flexibiliteit om een vooraf gedefinieerde data analyse pipeline toe te passen, om deze pipelines aan te passen met hun eigen code, en om toegang te krijgen tot open-source tools ontwikkeld door de bio-informatica gemeenschap.

De GeoMx DSP is een volledig geautomatiseerde ruimtelijke profiler die multi-cellulaire analyse van het gehele transcriptoom mogelijk maakt voor toepassingen bij zowel mensen als muizen, en kan worden aangepast voor andere soorten.