Bionano Genomics, Inc. kondigde de lancering aan van meerdere nieuwe producten en verbeteringen voor zijn optical genome mapping workflow die een verbeterde robuustheid in monstervoorbereiding bieden, een kortere doorlooptijd voor DNA-labeling en beeldvorming, en verbeteringen in doorvoer en kwaliteitsmetingen. De nieuwe versies van Bionano's sample prep kits, chips en instrument software komen tegemoet aan de feedback van klanten en kunnen de prestaties verbeteren bij routinematige genoomanalysetoepassingen in grotere volumes. Bionano's sample prep kits worden gebruikt voor het extraheren en labelen van ultrahoog moleculair gewicht (UHMW) DNA voor gebruik op het Saphyr systeem.

Deze kits zijn geoptimaliseerd voor het uitvoeren van Bionano OGM-toepassingen op verschillende soorten monsters. De kits van generatie 2 zullen bloedmonsters, cellijnen en beenmergaspiraten ondersteunen; versies voor weefsel- en tumormonsters worden later in 2023 verwacht. De Bionano Prep SP-G2 (SP-G2) en Bionano Prep Direct Label and Stain (DLS-G2) kits zijn ook in omvang toegenomen van 10-reactie naar 12-reactie kits, een upgrade die beter aansluit bij de chip verbruiksgoederen van het bedrijf.

De SP-G2 kit verbetert de UHMW DNA-isolatie en zorgt voor een hoger slagingspercentage van de monsters, minder gebruikersfouten en meer gegenereerde gegevens per run. Een van de belangrijkste verbeteringen in de monstervoorbereiding is de mogelijkheid om DNA van hogere kwaliteit te isoleren, met name voor marginale monsters. Het nieuwe protocol kan ook tijd- en procesbeperkingen wegnemen en maakt de lysisstap gebruiksvriendelijker en beter geoptimaliseerd voor runs met verschillende monstertypes, waardoor gebruikers tot zes monsters tegelijk kunnen batchen.

Deze verbeteringen in de chemie kunnen uiteindelijk resulteren in een grotere DNA-doorvoer voor meer gegenereerde gegevens per monsterrun. Bovendien ondersteunt een afgeleide van de SP-G2 kit de automatische UHMW DNA-isolatie van Hamilton's Long String Vantage. Met de DLS-G2-kit van Bionano kan de labeling in slechts vijf uur worden voltooid, zodat gelabeld DNA nog dezelfde dag op het Saphyr-instrument kan worden geladen.

Door deze verbeterde chemie kan de doorlooptijd (of de tijd tussen monster en antwoord) worden verkort en is het mogelijk om in slechts drie dagen antwoorden van grote diepte te krijgen voor kankermonsters. Bionano heeft de stabiliteit van het reagens verhoogd van negen maanden naar één jaar voor de DLS-G2 kit, om in overeenstemming te zijn met de SP-G2 kit, wat kan leiden tot minder verspilling van reagentia en meer bruikbaarheid over een langere periode. De Saphyr Chip G3.3, een nieuwe versie van de instrumentbesturingssoftware (ICS v5.3) en een nieuwe versie van Bionano Access (v.1.7.2) maken een verbeterde verwerkingscapaciteit en succespercentages mogelijk wanneer twee Saphyr Chips parallel worden geladen, waardoor drie tot zes meer monsters per werkweek kunnen worden verwerkt.

Deze doorvoerverbeteringen komen voort uit een vermindering van de monsterverdamping en vergroten de betrouwbaarheid van het laden van monsters en de prestaties op het Saphyr-instrument. Een hogere verwerkingscapaciteit resulteert ook in betere first-pass opbrengsten en kan het risico van monsteruitputting wegnemen bij het werken met complexe monsters met een langere scantijd, zoals bij kankeronderzoek of celbioprocessing. ICS v5.3-ondersteuning voor de Saphyr Chip G3.3 verbetert de consistentie van de doorvoer over verschillende runs en de robuustheid van de uitlijning.