Avalon GloboCare Corp. heeft een nieuwe studie aangekondigd waarin de met kunstmatige intelligentie (AI) verbeterde QTY Code technologie voor eiwitontwerp wordt toegepast. Verwacht wordt dat de methode de ontwikkeling van therapeutische monoklonale antilichamen voor de behandeling van kanker zal versnellen.

Het onderzoek demonstreert een nieuwe methode voor het snel voorspellen van het ontwerp van zogenaamde waterminnende of hydrofiele variantstructuren van de 14 glucose transport membraan-eiwitten in cellen, waardoor onderzoekers de eiwitten gemakkelijker in water kunnen bestuderen. Glucose transport membraan-eiwitten zijn gedereguleerd in vele tumorsoorten en zijn een potentieel belangrijk doelwit voor kankertherapie. De studie is op 27 juni 2022 gepubliceerd in QRB Discovery, een peer-reviewed, onderzoekstijdschrift over biologische functie, structuur en mechanisme.

De doorbraaktechnologie QTY Code, ontwikkeld door Avalon en het laboratorium van Dr. Shuguang Zhang, Ph.D., van het Medialab van MIT in Boston, MA, is een proteïne-ontwerp-platform dat in water onoplosbare transmembraan-receptoreiwitten kan veranderen in in water oplosbare eiwitten, waardoor ze gebruikt kunnen worden in vele klinische toepassingen, waaronder de ontwikkeling van geneesmiddelen. Een team van wetenschappers onder leiding van Dr. Zhang paste de QTY code toe op de 14 glucose transport membraan-eiwitten die suiker naar de cellen transporteren. Zij gebruikten daarvoor Google's AlphaFold2, een AI-programma van DeepMind, dat nauwkeurig en snel kan voorspellen hoe eiwitten zich vouwen.

Dr. Zhang en zijn team gebruikten de QTY-code met het open-source AlphaFold2 om de structuren van deze eiwitten te voorspellen, zowel in hun natuurlijke hydrofobe vormen als in hun door de QTY-code veranderde wateroplosbare vormen. Auteurs van het QRB Discovery-paper zijn Dr. Zhang en Eva Smorodina, een stagiaire structurele biologie in het Greiff Lab aan de Universiteit van Oslo; Drs. Fei Tao en Rui Qing van de Shanghai Jiaotong Universiteit (Dr. Qing was eerder postdoctoraal onderzoeker in het MIT Media Lab en later onderzoekswetenschapper aan het Koch Institute for Integrative Cancer Research van het MIT); Dr. Steve Yang, een MIT-alumnus en nu bij PT Metiska Farma in Indonesië; en Dr. David Jin, M.D., Ph.D. van Avalon GloboCare Corp., wiens samenwerking Dr. Zhang heeft geholpen bij zijn onderzoek naar de toepassing van de QTY code op de studie van kankercellen.

Avalon GloboCare financierde het onderzoek.