Het ministerie zei dat de protesten in de zuidelijke stad bij de grens met Senegal laat op maandag gewelddadig werden, wat de veiligheidstroepen ertoe aanzette om de demonstranten te confronteren en bepaalde groepen in hechtenis te nemen.
"Helaas zijn onder deze omstandigheden drie demonstranten omgekomen. Twee van hen stierven in de detentiefaciliteit in het bijzijn van hun medegevangenen, terwijl de derde later in het ziekenhuis overleed," zei het in een verklaring.
Het gaf geen verdere details over hun doodsoorzaak of het aantal arrestanten, maar zei dat er een onderzoek zou worden uitgevoerd.
De onrust volgde op een aankondiging op zondag dat president Mohamed Ould Ghazouani een tweede termijn had gewonnen, volgens voorlopige resultaten die zijn belangrijkste rivaal, de antislavernij activist Biram Dah Abeid, verwierp vanwege vermeende onregelmatigheden.
Op dinsdag beperkten de autoriteiten de toegang tot mobiel internet "vanwege protesten tegen de resultaten van de presidentsverkiezingen van dit weekend", aldus internetmonitor Netblocks.
Bezorgdheid van de oppositie over de geloofwaardigheid van het verkiezingsproces leidde ook na de presidentsverkiezingen van 2019 tot kleinschalige protesten.
