Olink Holding AB (publ) meldt de publicatie van drie artikelen in het prestigieuze wetenschappelijke tijdschrift Nature, die de kracht aantonen van het Olink Explore platform voor het uitvoeren van proteogenomische studies op bevolkingsschaal. De studies gebruikten elk gegevens die gegenereerd waren door het UK Biobank Pharma Proteomics Project (UKB-PPP), waarbij 13 farmaceutische bedrijven nieuwe proteomische gegevens genereerden door toegang te krijgen tot de UK Biobank. Met behulp van het Olink Explore platform hebben onderzoekers ongeveer 3.000 eiwitten gemeten in meer dan 54.000 monsters van UKB-deelnemers.

Door genomische en proteomische analyses op een ongekende schaal te combineren, is er een schat aan nieuwe informatie beschikbaar over de genetische effecten op eiwitexpressie en fenotypische resultaten. De bevindingen illustreren de immense waarde van proteogenomica voor het ophelderen van biologische mechanismen, het identificeren van nieuwe biomarkers die gebruikt kunnen worden en het versnellen van de ontwikkeling van medicijnen. Het artikel van Sun et al.

van het UKB-PPP consortium biedt de eerste gedetailleerde samenvatting van de gegevens, vergezeld van downstream op GWAS gebaseerde proteogenomische analyses, het in kaart brengen van proteïne kwantitatieve trait loci (pQTL), dwarsdoorsnede ziekteassociaties en proteomische voorspellingen van demografische factoren en fysiologische functies. Door meer dan 14.000 genetische associaties met eiwitexpressieniveaus bloot te leggen, waarvan 81% nieuw is, tonen hun bevindingen in dit baanbrekende artikel duidelijk het belang aan van high-throughput eiwitmetingen voor het identificeren van belangrijke biologische routes en hun invloed op de gezondheid. Een tweede paper van Dhindsa et al., voornamelijk geschreven door consortiumleden van AstraZeneca, gebruikte de in de paper beschreven dataset om genetische associaties van zeldzame eiwitcoderingsvarianten met eiwitexpressie te bestuderen.

De resultaten werpen licht op de vitale rol van zeldzame varianten in de variatie van plasma-eiwitniveaus en biologische resultaten, en onderstrepen de cruciale behoefte aan grootschalige proteogenomische studies om dergelijke ontdekkingen mogelijk te maken. Het derde artikel van Eldjarn et al. beschrijft een onderzoek waarbij de door Olink gegenereerde resultaten in de UKB-PPP dataset werden vergeleken met de proteogenomische analyse van een groot IJslands bevolkingscohort met behulp van een aptameer-gebaseerde technologie.

Hoewel beide platforms een groot aantal genetische associaties met eiwitniveaus identificeerden, was een significant hoger aandeel van de eiwitten die met Olink gemeten werden (72% versus 43% bij gebruik van de aptameer-gebaseerde technologie) geassocieerd met cis-pQTL's, wat een sterke genetische bevestiging is voor de superieure specificiteit van de Olink assays. Bovendien waren de mediane CV-ratio's lager voor de Olink assays, wat aangeeft dat ze gemiddeld nauwkeuriger waren.