Magubane begon in 1955 bij het tijdschrift Drum en verwierf bekendheid als een van de weinige zwarte fotografen die het repressieve tijdperk versloeg.
Een van zijn historische foto's, een jaar later genomen in een rijke buitenwijk van Johannesburg, liet een blank meisje zien dat op een bankje zat met een bordje "Alleen Europeanen" erop, terwijl een zwarte arbeider achter haar haar zat te kammen.
In de jaren 1960, te midden van een golf van anti-apartheidsactivisme, versloeg hij de arrestatie van Nelson Mandela en het verbod op de nu regerende African National Congress (ANC) partij.
Een decennium later won hij internationale lofbetuigingen met zijn reportages over de studentenopstand in Soweto.
Hij werd regelmatig lastiggevallen, aangevallen, gearresteerd en vanaf 1969 586 dagen in een isoleercel opgesloten.
Maar Magubane bleef foto's maken en werd in de jaren 1990 aangesteld als de officiële fotograaf van de pas vrijgelaten Mandela.
Hij was "iemand die zeer grote offers heeft gebracht voor de vrijheid waar we vandaag de dag van genieten," vertelde zijn kleindochter Ulungile Magubane aan Reuters.
"Gelukkig leefde hij nog om het land ten goede te zien veranderen," zei ze.
Magubane werd in 1932 geboren in de Johannesburgse buitenwijk Vrededorp - nu Pageview - en groeide op in Sophiatown, ooit een centrum voor beroemde zwarte kunstenaars dat uiteindelijk onder de apartheid werd vernietigd.
Hij stierf vredig rond het middaguur, zei zijn dochter Fikile Magubane. Hij zou op 18 januari 92 jaar geworden zijn.
