De stembussen gingen op de meeste plaatsen op tijd open om 0730 GMT, maar in sommige gebieden arriveerden de verkiezingsfunctionarissen te laat. Het stemmen eindigt om 1330 GMT.
De Onafhankelijke Nationale Kiescommissie (INEC) ligt onder vuur nadat waarnemers van de Europese Unie, het Gemenebest en andere instanties verschillende problemen meldden tijdens de verkiezingen van vorige maand, waaronder tekortkomingen in systemen die zijn ontworpen om manipulatie van de stemmen te voorkomen.
De waarnemers bekritiseerden de INEC voor slechte planning en stemvertragingen, maar beschuldigden de INEC niet van fraude.
Gouverneurs hebben een enorme invloed in Afrika's dichtstbevolkte land van meer dan 200 miljoen mensen en hun steun bepaalt vaak wie president wordt. Sommige gouverneurs zitten staten voor waarvan de jaarlijkse budgetten groter zijn dan die van sommige kleine Afrikaanse landen.
De INEC heeft de gouverneursverkiezingen met een week uitgesteld, naar eigen zeggen om de elektronische stemmachines te herconfigureren die centraal staan in het geschil over de presidentsverkiezingen die gewonnen zijn door Bola Tinubu van de regerende All Progressives Congress (APC) partij.
Atiku Abubakar van de People's Democratic Party (PDP), de grootste oppositiepartij, en Peter Obi van de Labour Party hebben de stemming als frauduleus van de hand gewezen en zullen de resultaten voor de rechter aanvechten.
Kiezers zullen gouverneurs kiezen in 28 van de 36 staten. In alle staten worden nieuwe staatsvergaderingen gekozen.
OGEN OP LAGOS
De race die de meeste interesse heeft gewekt, vindt plaats in Lagos, de thuisstaat van Tinubu en het commerciële centrum van Nigeria, waar hij de bijnaam "peetvader" heeft gekregen vanwege zijn blijvende politieke invloed.
Op het spel staat de controle over een jaarlijks budget van 4 miljard dollar en het besturen van Afrika's grootste megastad met meer dan 20 miljoen inwoners, waar enkele van de miljardairs van het land wonen, waaronder Aliko Dangote die een olieraffinaderij van meerdere miljarden dollars aan het bouwen is.
Maar Lagos wemelt ook van de armoede omdat miljoenen mensen in sloppenwijken wonen zonder stroom en stromend water, en inwoners, arm en rijk, dagelijks verkeersopstoppingen en vervuiling te verduren hebben.
Tinubu regeerde Lagos van 1999 tot 2007 en heeft sindsdien een belangrijke rol gespeeld bij het kiezen van elke opvolger.
Obi, wiens steun van jonge en stedelijke kiezers kwam, versloeg Tinubu vorige maand in Lagos. Dat heeft zijn Labourpartij, die ernaar streeft om de APC te onttronen van het besturen van de staat, gestimuleerd.
De zittende APC'er Babajide Sanwo-Olu, die al twee decennia deel uitmaakt van de Lagos deelstaatregering, wordt sterk uitgedaagd door Gbadebo Rhodes-Vivour van de Arbeidspartij, een architect en politiek activist.
De twee kandidaten en Tinubu hebben afzonderlijk gestemd in Lagos.
Gbadebo Rhodes-Vivour beweerde zaterdag dat er kiezers geïntimideerd waren en zei dat sommige stembureaus zonder waarschuwing door de INEC verplaatst waren. Een woordvoerder van INEC reageerde niet onmiddellijk op verzoeken om commentaar.
Nigerianen zullen ook letten op de race in het noordoosten van Adamawa, een conservatieve en grotendeels islamitische staat, die de eerste gekozen vrouwelijke gouverneur van het land zou kunnen opleveren.
Er waren vorige maand minder gevallen van verkiezingsgeweld, maar er blijft bezorgdheid bestaan over mogelijke botsingen in staten als Kano in het noorden en het olieproducerende Rivers in het zuiden, die in het verleden getuige zijn geweest van geweld na verkiezingen.
