De rente op de langstlopende JGB's steeg het meest, als reactie op de hogere overzeese rente vannacht en mogelijk wat winstnemingen aan het einde van het jaar toen beleggers hun boeken sloten, aldus analisten.
De tweejaarsrente daalde echter na een sterke vraag op een veiling van deze effecten.
De yen bleef schommelen rond 152 per dollar, een niveau dat eerder een interventie van yen-aankopen stimuleerde om de yen te ondersteunen.
De munt verzwakte donderdag tot 151,875, wat leidde tot de strengste waarschuwing van Tokio sinds de laatste interventie in oktober 2022, waarbij minister van Financiën Shunichi Suzuki dreigde met "beslissende stappen" om buitensporige dalingen aan te pakken.
Suzuki herhaalde deze zin vrijdag niet, maar herhaalde dat ambtenaren de valutabewegingen "met een hoge mate van urgentie" in de gaten hielden, en voegde eraan toe dat het ministerie zich richtte op de snelheid van de bewegingen en niet op specifieke niveaus.
De yen handelde vanaf 0600 GMT op 151,37 per dollar, weinig veranderd ten opzichte van donderdag.
"MOF wordt in een hoek gedrukt, denk ik," zei Shoki Omori, chief Japan desk strateeg bij Mizuho Securities.
"De volatiliteit is nog steeds laag, dus ze hebben moeite om een goede reden te vinden om in te grijpen."
Het rendement van de 10-jaars JGB steeg met 2 basispunten (bps) naar 0,725%, terwijl de benchmark 10-jaars JGB futures 0,21 yen daalden en de dag eindigden op 145,67. Obligatierendementen stijgen wanneer de prijzen dalen.
Het rendement op 30-jaars JGB steeg met 4,5 basispunten naar 1,810%.
De tweejaars rente daalde echter met 1 bp naar 0,175%.
De yen en de JGB-rente zijn blijven dalen, ondanks de beslissing van de Bank of Japan (BOJ) om vorige week te stoppen met het negatieve rentebeleid en haar eerste renteverhoging sinds 2007 door te voeren.
"De voorkeur voor hogere rendementen in zowel kortere als langere looptijden blijft bestaan, aangezien de BOJ de rente dit jaar waarschijnlijk opnieuw zal verhogen," aldus Omori van Mizuho.
Meer sterke economische cijfers uit de VS kunnen ook druk uitoefenen op hogere rendementen, omdat de rente op schatkistpapier stijgt, zei hij. De favoriete inflatiemeter van de Federal Reserve, de PCE deflator, wordt later op vrijdag verwacht.
Hoewel Japanse functionarissen misschien niet blij zijn met de zwakte van de yen, zijn aandelenbeleggers dat wel.
Het Nikkei-aandelengemiddelde steeg vorige week vrijdag naar een recordhoogte van 41.087,75 en sloot het kwartaal af met de grootste stijging ooit in absolute termen.
De Japanse aandelenbenchmark steeg in de periode van drie maanden met 12.328 punten en sloot af op 40.369,44, een stijging van meer dan 20% die de stijging van de MSCI World index met 8,4% ver overtrof. (Verslaggeving door Kevin Buckland; Bewerking door Mrigank Dhaniwala)
