NanoString Technologies, Inc. en Visiopharm A/S hebben een samenwerking aangekondigd om de ontdekking van nieuwe biomarkers en drug targets te versnellen met behulp van de nieuwste ruimtelijke beeldvorming en machine learning technologieën. NanoString en Visiopharm ontwikkelen samen geïntegreerde workflows die gebruik maken van de multiplexing mogelijkheden van de GeoMx® Digital Spatial Profiler (DSP) en de AI-gestuurde beeldanalyse mogelijkheden van Visiopharm. NanoString's nieuwe cloud informatica platform, het AtoMx™ Spatial Informatics Platform, zal de integratie verbeteren door schaalbare rekenkracht te bieden met wereldwijde toegang.

De integratie van Visiopharm's Oncotopix® Discovery software in de GeoMx DSP workflow zal de verwerking van monsters voor translationele onderzoekstoepassingen verbeteren en vereenvoudigen. Onderzoekers kunnen de AI-algoritmen van Visiopharm gebruiken om vierkleuren fluorescerende beelden te analyseren die op GeoMx worden gegenereerd, evenals bijbehorende beelden met behulp van hematoxyline en eosine (H&E) kleuring, om beter inzicht te krijgen in het aantal en type cellen binnen DSP-profielgebieden. De combinatie van deze technologieën zal naar verwachting het ontdekken en valideren van biomarkers versnellen met in situ whole transcriptome en high-plex eiwitanalyse.

Bovendien zullen NanoString en Visiopharm het bestandsformaat compatibel houden, zodat onderzoekers GeoMx DSP whole-slide beelden kunnen analyseren met de Visiopharm software, wat toegang geeft tot een rijke toolset voor pathologische en ruimtelijke analyse, waaronder celtellingen, fenotype mapping, afstandsmetingen, en meer, die gebruikt kunnen worden om de high-plex ruimtelijke moleculaire gegevens te verbeteren en te valideren.