NIKKEI 225 
De yen daalde van zijn hoogste niveau sinds juli 1990, dat in de vorige sessie werd bereikt.
De bredere Topix daalde met 0,64% tot 2.145,36.
"Beleggers wachtten op een moment om aandelen te verkopen en de sterkte van de yen werd een trigger," zei Jun Morita, algemeen directeur van de onderzoeksafdeling bij Chibagin Asset Management.
"Het tempo van de koopgolf door buitenlanders lijkt te vertragen. Hoeveel zij in de toekomst nog binnenlandse aandelen zullen kopen, zal een sleutelrol spelen."
De dollar daalde vannacht nadat de Japanse topdiplomaat voor valuta dinsdag zei dat het land de bewegingen op de valutamarkt nauwlettend in de gaten zal houden en indien nodig "gepast" zal reageren.
De opmerkingen werden gemaakt nadat financiële autoriteiten bijeenkwamen in reactie op de verzwakking van de yen tot het laagste niveau in zes maanden ten opzichte van de dollar.
De aandelen van Advantest, maker van chiptestapparatuur, daalden met 1,71% en voerden de verliezen in de Nikkei aan. De maker van chipapparatuur Tokyo Electron daalde bijna 1% en Fast Retailing, eigenaar van het merk Uniqlo, verloor 1,08%.
Toyota-dochter Hino Motors steeg met 13% nadat Daimler Truck Holding AG en Toyota Motor een voorlopige overeenkomst hadden gesloten om hun vrachtwageneenheden in Japan samen te voegen.
Volgens het memorandum of understanding (MOU) zullen de activiteiten van Mitsubishi Fuso Truck and Bus Corp, eigendom van Daimler, en Hino Motors worden samengevoegd in een holding.
De aandelen van Toyota daalden met 1,01%.
Staalproducenten verloren 1,93% en werden daarmee de grootste verliezer onder de 33 subindexen van de Tokyo Stock Exchange. Olie- en gasexploratiebedrijven daalden 1,82%.
Van de Nikkei-componenten gingen 32 aandelen vooruit, terwijl 189 daalden en vier gelijk bleven.
