De maatregel komt nadat Groot-Brittannië in november zijn departementen had gevraagd geen Chinese bewakingscamera's meer te installeren in gevoelige gebouwen. Sommige Amerikaanse staten hebben leveranciers en producten van verschillende Chinese technologiebedrijven verboden.
"Dit is een probleem en ... we doen een evaluatie van alle bewakingstechnologie binnen defensie (departement) en waar deze specifieke camera's worden aangetroffen, zullen ze worden verwijderd," vertelde Marles in een interview aan ABC Radio.
Oppositiewetgever James Paterson zei donderdag dat zijn eigen onderzoek had uitgewezen dat bijna 1.000 apparaten van Hangzhou Hikvision Digital Technology en Dahua Technology Co - twee Chinese bedrijven die gedeeltelijk in handen van de staat zijn - geïnstalleerd waren in meer dan 250 Australische overheidskantoren.
Paterson, de schaduwminister voor cyberveiligheid en het tegengaan van buitenlandse inmenging, drong er bij de regering op aan dringend met een plan te komen om al deze camera's te verwijderen.
Marles zei dat de kwestie belangrijk was, maar "ik denk niet dat we het moeten overdrijven".
Australische media meldden woensdag dat het nationale oorlogsmonument in Canberra verschillende beveiligingscamera's van Chinese makelij zou verwijderen uit vrees voor spionage.
Hikvision en Dahua Technology reageerden niet onmiddellijk op een verzoek om commentaar.
Australië en China hebben geprobeerd de diplomatieke banden te herstellen nadat Canberra in 2018 Huawei uit zijn 5G-breedbandnetwerk had geweerd. Dat bekoelde verder nadat Australië om een onafhankelijk onderzoek naar de herkomst van COVID-19 had gevraagd.
China reageerde met tarieven op verschillende Australische producten.
Premier Anthony Albanese zei dat hij zich geen zorgen maakte over hoe Beijing zou kunnen reageren op de verwijdering van camera's.
"Wij handelen in overeenstemming met het nationale belang van Australië. Dat doen we op transparante wijze en dat zullen we blijven doen", zei Albanese tegen verslaggevers.
